樣品處理區域在實驗過程中會產生大量的有毒有害、有刺激氣味的氣體，故必須有獨立排風設施通風柜；一般為單獨的房間，地面應有地漏；墻面、地板、實驗臺和試劑柜等要絕緣、耐熱、耐酸堿和耐有機溶劑腐蝕；放置中央實驗臺的實驗室應預設供實驗臺用的上下水裝置和足夠的電源插座。

理化實驗室通風設計以化學實驗室為主，其通風方式主要有通風柜、排氣罩和排風管，其目的是為避免人員因長期在危險空氣中工作而傷害到身體健康；排走儀器設備產生的熱量和雜質。宜根據設備的要求，用通風管道及風機進行通風排氣以保證設備正常運行。

實驗室要有一定的換氣次數，以保證室內揮發性有害物質及時排出室外，換氣次數與通風柜數量及每個通風柜換氣量有關，通常實驗室無人時換氣次數為5～6次／h。實驗室的噪聲一般應小于55 dB，故用于提供室內排風的風機應盡量放置于室外，必要時可設通風機房。可將風機放置于樓頂，便于檢修，易于消聲和減振，同時置于樓頂不占用使用面積，且使室內的排風管道處于負壓狀態，以免有害物質由于管道的腐蝕或損壞而滲入室內

如實驗室在工作時會產生有毒有害氣體，則需要安裝相應的實驗室廢氣處理經過處理的廢氣才可排放至大自然中。